רשות ניקוז ונחלים ירדן דרומי פועלת להסדרת מערכות הניקוז ומניעת הצפות, בשילוב שיקום ופיתוח נחלים ומרחבים טבעיים לאורך אגן ההיקוות. עבודתנו כוללת ניהול וניתוב מי הנגר העילי לערוצי הנחלים מהמעלה, דרך המורד ועד לירדן הדרומי, באמצעות תכנון וביצוע מפעלי ניקוז, שיקום אקולוגי ונופי, החזרת מים לטבע, שימור קרקע, ועוד.